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Présentation de MOLECULES

INTRODUCTION

CHIME

MOLECULES

METHODE

EXEMPLE



chim1.gif (1407 octets)chim2.gif (2039 octets)chim3.gif (2780 octets)chim4.gif (4233 octets)chim6.gif (1713 octets)chim1.gif (1407 octets)

- CHIME:
chimenow.gif (2254 octets) : pour télécharger le plug-in CHIME sur le site de MDLI (Windows 3.1, Windows 95/98, MacIntosh, PowerMac et SGI)

1-Intérêt de ce plug-in : Il permet de visualiser et de manipuler des molécules en 3D dans un navigateur Internet.
Voici quelques exemples de ce que l'on peut observer (captures d'écran)

chim1.gif (1407 octets)    wireframe chim2.gif (2039 octets)sticks

chim3.gif (2780 octets)ball & stick

 chim4.gif (4233 octets)spacefill

chim5.gif (3604 octets)option : dot surface

chim6.gif (1713 octets)en 2D

2 Utilisation du plug-in Si vous avez installé le plug-in vous pouvez observer la molécule de carvone en cliquant ici:

------->EXEMPLE<-------

3 Configuration

Parfois le plug-in CHIME refuse obstinément de fonctionner hors-connexion. Dans ce cas, il faut effectuer la manipulation suivante:

Explorateur de Windows 95 / menu AffichageOptions /Cliquer sur l'onglet Types de fichiers puis sur le bouton Nouveau Type. Compléter ensuite de la façon suivante:

  pour les fichier mol pour les fichiers pdb
Description du type MDL Molfile Brookhaven Protein Databank
Extension associée .mol .pdb
Type de contenu (MIME) chemical/x-mdl-molfile chemical/x-pdb

Décocher ensuite la case : confirmer l'ouverture après téléchargement . Enfin valider avec OK

Remarques

  • Les molécules en format .mol affichent les doubles liaisons
  • les molécules en .pdb ne les affichent pas
  • Les molécules en .pdb peuvent être visualisées par le logiciel RASMOL téléchargeable sur INTERNET

Auteur : JF Noblet : http://perso.infonie.fr/jf_noblet/index.htm